一、职能科室：
　　组织人事科、宣传科、党（院）办、工会、团委、品牌推广部、监察审计科、医务科、科教科、质量管理科、护理部、院感办、经济管理科、出入院管理科、学生公寓管理中心、防保科、财务科、保卫科、信息中心、网络中心、基建科、设备科、医保办、总务科、膳食科、一门诊办公室、二门诊办公室、友谊医院办公室。

二、 临床科室：
　　心血管科（含CCU）、血液科、肾病科（含透析中心）、消化内科、神经内科、呼吸科、内分泌科、泌尿外科（含碎石中心）、心胸外科、普外科、骨科、神经外科、妇产科、儿科、感染性疾病科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、麻醉科、康复医学科、老年病科、皮肤科、中医科、肝胆外科、微创治疗中心、ICU病房、烧伤整形外科、肿瘤科（含肿瘤外科、肿瘤内科）、介入治疗中心、急诊科、血管外科、干部病房、社区服务中心、健康体检中心。

三、医技科室：
　　检验科、药剂科（含制剂、医学药理）、放射科、影像中心、功能科、内窥镜室、核医学科、病理科、手术室、中心消毒供应室、输血科、中心实验室。